抗原胜肽(Peptides)被切成短片段胺基酸。
依據8-12 mer(HLA-I)、12-30 mer (HLA-II)裝載於胜肽結合槽(peptide binding cleft)。
形成胜肽-HLA(peptide-HLA;pHLA)將抗原表位(Antigenic Epitope)呈遞給配體:如T細胞受器(T Cell Receptor;TCR)或B細胞受器(B Cell Receptor;BCR)等辨識,引發免疫反應。
提取DNA比提取RNA簡單、分子穩定、汙染程度較低。
一種蛋白質可能經過多種不同DNA轉錄(Transcription)、RNA轉譯(Translation)形成,源頭分析較單純。
抗原胜肽與HLA結合發生於內質網(Endoplasmic Reticulum;ER)後又經歷修飾,源頭分析較單純。
抗原胜肽結合HLA所形成胜肽-HLA庫(Repertoire)數量龐大,能引發免疫原性(Immunogenicity)者少。
減少抗原處理(Antigen Processing)時溶析配體(Eluted Ligands;ELs)的誤差。
方便進行鍵結親和力(Binding Affinity;BA)的預測。
基因數據可重覆比對、經濟效益高、有益後續建庫及免疫胜肽組學(Immunopeptidome)分析使用。